Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
SMARCA2P51531 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SMARCA2P51531 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SMARCA2P51531 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms