Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBP50607 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBP50607 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBP50607 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBP50607 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBP50607 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBP50607 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBP50607 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBP50607 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBP50607 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBP50607 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBP50607 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBP50607 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms