Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETV1P50549 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETV1P50549 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ETV1P50549 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ETV1P50549 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ETV1P50549 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ETV1P50549 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ETV1P50549 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ETV1P50549 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ETV1P50549 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ETV1P50549 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ETV1P50549 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ETV1P50549 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms