Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITPNBP48739 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms