Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCT5P48643 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCT5P48643 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCT5P48643 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCT5P48643 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms