Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NRIP1P48552 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NRIP1P48552 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms