Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LSSP48449 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LSSP48449 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LSSP48449 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LSSP48449 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSSP48449 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSSP48449 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSSP48449 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LSSP48449 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LSSP48449 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LSSP48449 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms