Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNA4P43681 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CHRNA4P43681 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms