Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HTTP42858 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTTP42858 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTTP42858 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTTP42858 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTTP42858 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTTP42858 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTTP42858 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTTP42858 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTTP42858 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTTP42858 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HTTP42858 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
HTTP42858 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTTP42858 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTTP42858 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTTP42858 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTTP42858 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTTP42858 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTTP42858 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms