Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF4A3P38919 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF4A3P38919 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms