Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BRCA1P38398 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
BRCA1P38398 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms