Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TGFBR1P36897 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TGFBR1P36897 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms