Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNA7P36544 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CHRNA7P36544 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms