Protein–RNA interactions for Protein: P35670

ATP7B, Copper-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7BP35670 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ATP7BP35670 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ATP7BP35670 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ATP7BP35670 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms