Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXD12P35452 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
HOXD12P35452 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms