Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFC1P35251 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFC1P35251 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFC1P35251 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RFC1P35251 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms