Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTNNB1P35222 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms