Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GPC1P35052 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GPC1P35052 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GPC1P35052 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GPC1P35052 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GPC1P35052 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GPC1P35052 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GPC1P35052 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GPC1P35052 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms