Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HOXA11P31270 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HOXA11P31270 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms