Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC25CP30307 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC25CP30307 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms