Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5DP30049 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5DP30049 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.2 ms