Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PSMB9P28065 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PSMB9P28065 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms