Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KDELR1P24390 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KDELR1P24390 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms