Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFX1P22670 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFX1P22670 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFX1P22670 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFX1P22670 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX1P22670 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX1P22670 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RFX1P22670 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFX1P22670 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms