Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FGFR3P22607 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR3P22607 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms