Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SYT1P21579 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT1P21579 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT1P21579 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT1P21579 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT1P21579 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT1P21579 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SYT1P21579 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT1P21579 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms