Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
HOXA5P20719 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms