Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NR1D1P20393 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NR1D1P20393 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms