Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SDSP20132 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SDSP20132 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDSP20132 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDSP20132 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDSP20132 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDSP20132 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDSP20132 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDSP20132 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDSP20132 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDSP20132 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDSP20132 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDSP20132 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms