Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PDE6GP18545 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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PDE6GP18545 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDE6GP18545 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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