Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYN1P17600 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYN1P17600 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYN1P17600 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYN1P17600 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYN1P17600 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYN1P17600 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYN1P17600 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SYN1P17600 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYN1P17600 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SYN1P17600 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SYN1P17600 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SYN1P17600 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SYN1P17600 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SYN1P17600 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms