Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSPA6P17066 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSPA6P17066 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms