Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CREB1P16220 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CREB1P16220 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CREB1P16220 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CREB1P16220 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CREB1P16220 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CREB1P16220 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CREB1P16220 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms