Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFTRP13569 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFTRP13569 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFTRP13569 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFTRP13569 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFTRP13569 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFTRP13569 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFTRP13569 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CFTRP13569 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFTRP13569 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFTRP13569 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFTRP13569 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFTRP13569 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CFTRP13569 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
CFTRP13569 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CFTRP13569 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFTRP13569 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFTRP13569 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFTRP13569 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms