Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD8P13378 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD8P13378 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms