Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

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Length 1,609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
LAMC1P11047 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
LAMC1P11047 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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