Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GLI4P10075 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GLI4P10075 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GLI4P10075 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GLI4P10075 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GLI4P10075 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GLI4P10075 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms