Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TMEM225BP0DP42 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms