Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf89P0DMQ9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf89P0DMQ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf89P0DMQ9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf89P0DMQ9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C8orf89P0DMQ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
C8orf89P0DMQ9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms