Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM200BP0CF97 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms