Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I0

USP17L8, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L8P0C7I0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP17L8P0C7I0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP17L8P0C7I0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
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