Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP17L7P0C7H9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP17L7P0C7H9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms