Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LDHBP07195 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LDHBP07195 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LDHBP07195 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LDHBP07195 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LDHBP07195 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms