Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOA2P02652 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOA2P02652 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA2P02652 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA2P02652 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA2P02652 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOA2P02652 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOA2P02652 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOA2P02652 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOA2P02652 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms