Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HLA-DQB1P01920 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HLA-DQB1P01920 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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