Protein–RNA interactions for Protein: P01766

IGHV3-13, Immunoglobulin heavy variable 3-13, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-13P01766 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-13P01766 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGHV3-13P01766 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms