Protein–RNA interactions for Protein: P00488

F13A1, Coagulation factor XIII A chain, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13A1P00488 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
F13A1P00488 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
F13A1P00488 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
F13A1P00488 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
F13A1P00488 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
F13A1P00488 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
F13A1P00488 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms