Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE8BO95263 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE8BO95263 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE8BO95263 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms