Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LRATO95237 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LRATO95237 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LRATO95237 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LRATO95237 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LRATO95237 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LRATO95237 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LRATO95237 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms