Protein–RNA interactions for Protein: O94955

RHOBTB3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBTB3O94955 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RHOBTB3O94955 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RHOBTB3O94955 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOBTB3O94955 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOBTB3O94955 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOBTB3O94955 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOBTB3O94955 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RHOBTB3O94955 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms